Uma dica útil pra quem está começando nessa área da web, é de fechar issues no github via commits.

Se você não tava ligado, vamos supor que você tenha os repositórios repo-a e o repositório repo-b em uma conta de login octo. No repo-a existe a issue #1, e no repo-b issue #2

Fechando uma issue

Digamos que esteja no repositório A e tenha resolvido a issue#1, basta explicitar na mensagem do commit

cd repo-a
git add -A //adiciona na arvore de alterações
git commit -am "resolvendo problema um. closes #1" //registra as alterações
git push origin master //envia para o github   

a palavra-chave closes #1 é parseada pelo github e ele entende que é pra fechar a issue#1 do repo-a. existem outros sinônimos que também funcionam:

• close
• closes
• closed
• fix
• fixes
• fixed
• resolve
• resolves
• resolved

Fechando uma issue de outro repositório

agora digamos que você esteja no repo a e tenha resolvido uma issue do repo b

cd repo-b
git add -A //adiciona na arvore de alterações
git commit -am "resolvendo problema dois. closes octo/repo-b#2" //registra as alterações
git push origin master //envia para o github   

Fechando múltiplas issues

Pra fechar as duas issues de qualquer lugar

cd repo-b
git add -A //adiciona na arvore de alterações
git commit -am "resolvendo problemas. closes octo/repo-a#1 octo/repo-b#2" //registra as alterações
git push origin master //envia para o github   

Ou se for no mesmo repositório…

cd repo-b
git add -A //adiciona na arvore de alterações
git commit -am "resolvendo problemas. closes #1 closes #2" //registra as alterações
git push origin master //envia para o github   

E é isso ai, se curtiu deixa seu comentário.